কোটচাঁদপু্র মডেল পাইলট মাধ্যমিক বিদ্যালয় ১৮৯৯ খ্রিষ্টাব্দে প্রতিষ্ঠিত হয়। এর পূর্ব নাম ছিল কোটচাঁদপুর ঊচ্চ ইংরেজি বিদ্যালয়। বিদ্যালয়টি ১১ই এপ্রিল ১৯০১ সালে কলকাতা বিশ্ববিদ্যালয় কর্তৃক চিরস্থায়ীভাবে স্বীকৃতি পায়। প্রথমে বিদ্যালয়টি অন্যত্র ছিল। ভারতবিভক্তির ঠিক আগমুহূর্তে স্কটল্যান্ড নিবাসী হ্যারল্ড ক্লাইভ ম্যাকলিঊড কোটচাঁদপুর উপজেলায় অবস্থিত তার ৩৩ বিঘা জমির উপর নির্মিত বাড়িটি ঐ উপজেলার সলেমানপুর নিবাসী ঊষা রানীর কাছে বিক্রয় করে চলে যান। ১৯৬৫ সালে ঊষা রানীর বাড়িটি মোহাম্মদ আশরাফ আলী বিনিময় সূত্রে পান। পরে মোহাম্মদ আশরাফ আলী উক্ত ৩৩ বিঘা জমি সহ বাড়িটি কোটচাঁদপুর মাধ্যমিক বিদ্যালয়কে দান করেন। তখন থেকে বিদ্যালয়টি বর্তমান স্থানেই আছে।